Son aquellos que se transfieren a la memoria RAM en el momento de cargarse el Sistema Operativo y se pueden ejecutar sin necesidad de tener el DOS presente en la unidad por defecto desde el cual se puede ejecutar el mandato.

Algunos comandos internos

CD o CHDIR: cambia de un directorio activo a otro. Sintaxis: CD: \ruta\directorio

CD..: Retrocede un directorio y CD\ se sale a raíz.

COPY: copia un archivo de un directorio a otro. Sintaxis: copy  fichero-origen  fichero-destino

XCOPY: copia varios archivos de un directorio a otro, también se puede utilizar para hacer copias completas de un disco duro. Sintaxis: xcopy origen [destino con los parámetros que desean ponerle].

REM: Permite que se incluyan comentarios (observaciones) o impide la ejecución de comandos en un programa. Sintaxis: REM  comentarios 

SET: se puede asignar valores a una o más variables.  Sintaxis: SET variable [variable=valor]

VER: muestra la versión del sistema operativo. Sintaxis: VER

VOL: muestra la etiqueta del disco duro y su volumen

MEM: muestra la cantidad de memoria RAM, la cantidad ocupada y la libre.

En contraposición con los comandos internos se almacena en archivos de comandos denominados transitorios o externos, y para ejecutarse necesitan de estos archivos, además los comandos externos tienen nombre propio y se pueden copiar de un disco a otro.

APPEND: Sirve para especificar trayectorias para ficheros de datos. Sintaxis: APPEND unidad/ficheros

BACKUP: Ejecuta una copia de seguridad de uno o más archivos de un disco duro a un disquete.

DELTREE: Borra un directorio sin importar que contenga subdirectorios con todos sus contenidos. Sintaxis: deltree [unidad
uta]

Chkdsk: este es un comando que revisa todo el disco duro del sistema, es decir que   analiza cada parte del disco informando si hay o no errores.

 DISKCOMP: compara el contenido de dos disquetes. Sintaxis: diskcomp [unidad1: [unidad2:]]

DISKCOPY: copia el contenido total de un disco o disquete, sirve para hacer copias de seguridad. Sintaxis: diskcopy, unidad origen,  unidad destino

DOSKEY: reside en la memoria y una vez activado, permite visualizar los comandos de MSDOS. Introducidos con anterioridad a través de la línea de comandos.

FC: Compara ficheros y verifica si las copias son exactas. Sintaxis: FC fichero1  fichero2

FORMAT: Formatea, o borra por completo un disco o disquete. Sintaxis: Format unidad

MOVE: Mueve o cambia de posición un directorio y ficheros. Sintaxis: move /Y origen   destino  (y es un parámetro).

TREE: muestra todos los directorios dependiendo en que unidad estemos en forma de árbol.